病理診断科は、専任病理医1名、大学からの応援医3名(月・水・金）、細胞検査士3名から構成されています。病理診断を専門とする診療科です。毎日、診療で提出される患者さんからの生検標本（胃、肺、肝臓、大腸、子宮頸部、咽頭、皮膚、骨髄など）、手術標本、細胞診標本（婦人科の子宮頸部・体部、乳腺穿刺吸引細胞診など）の診断を行っています。この診断により、患者さんの治療方針が決定しますので、非常に重要な分野です。
　手術中に癌の有無や、良悪の判定をする術中迅速診断（組織診・細胞診）も毎日のように行われています。これにより、術式変更が起こることもあります。
　当院で不幸にして亡くなられた患者さんに対しては、病理解剖（剖検）を行なうこともあります。これにはご遺族の承諾が必要です。剖検により、最終死因や、生前の臨床診断の確認、病変の広がりがわかります。全く予想もしていなかった病変が見出されることもあります。